Spalio pabaigoje Paryžiuje vykusiame tarptautiniame sintetinės biologijos konkurse „iGEM“ (angl. International Genetically Engineered Machine Competition) Vilniaus universito studentų komanda „Vilnius-Lithuania iGEM 2025“ laimėjo aukso medalį. Komandoje – ir dvi VU Matematikos ir informatikos fakulteto studentės: Viktorija Ramonaitė ir Augustė Tumaitė.
„Vilnius-Lithuania iGEM 2025“ komanda
Vienuoliktus metus gyvuojanti „Vilnius-Lithuania iGEM“ komanda šiemet kūrė inovatyvų įrankį, padėsiantį rinkti duomenis apie erkių platinamus patogenus – problemą, aktualią tiek Lietuvoje, tiek visame pasaulyje. Studentų sukurtas testas mokslininkams leis stebėti ne tik gerai žinomas ligas, tokias kaip Laimo liga, bet ir rečiau aptinkamus, visuomenei mažiau pažįstamus patogenus, pavyzdžiui, Rickettsia genties bakterijas.
VU studentai varžėsi su daugiau kaip 400 komandų iš daugiau kaip 50 šalių. Tarp varžovų buvo ir prestižinių pasaulio universitetų, tokių kaip Masačusetso technologijų institutas, Harvardo, Stanfordo, Kembridžo ir Oksfordo universitetai, komandos.
Anot VU MIF studenčių, joms dar labiau nei pats konkursas įsiminė apie 10 mėnesių vykęs pasiruošimas. Per šį ilgą laikotarpį komanda dirbo su projekto idėjos įgyvendinimu. Nors pagrindinis studentų tikslas buvo laboratorijoje kurti sintetine biologija paremtą produktą, projektas tuo neapsiribojo. Komandai buvo ne ką mažiau svarbu populiarinti mokslą, todėl jie aktyviai organizavo įvairius renginius, edukacijas ir vasaros stovyklas bei dalijosi savo žiniomis su visuomene.
Konkurso akimirka
„Kai tiek daug ir ilgai dirbama prie tokio didelio projekto, natūralu, kad visada norisi būti įvertintam, todėl džiaugiamės, kad į Lietuvą grįžome su aukso medaliu, taip pratęsdami mūsų universiteto komandos tradiciją šiame konkurse pakliūti tarp geriausių komandų“, – pasakoja V. Ramonaitė.
Kolegei pritaria ir A. Tumaitė: „Pasiruošimas ir bemiegės naktys įsiminė daug labiau nei pati konkurso pabaiga. Pati buvau IT komandos dalis, mūsų darbo krūvis nebuvo nuoseklus – didžiausi iššūkiai laukė rudenį, artėjant vadinamajam „užšaldymui“ (angl. wiki freeze), kai tiksi paskutinės sekundės į internetinį puslapį sukelti visą projekto informaciją. Tos dienos buvo labai intensyvios, teko pagerinti ir asmeninį beveik nepertraukiamo programavimo rekordą – tai truko 20 valandų, jos buvo praleistos VU Gyvybės mokslų centre esančiame „iGEM“ kambaryje“.
Viktorija pasakoja, kad apie konkursą buvo girdėjusi dar besimokydama gimnazijoje. Prie „Vilnius-Lithuania iGEM 2025“ ji prisijungė antrame kurse. Bioinformatiką studijuojanti mergina pasakoja, kad „iGEM“ jai pasirodė unikali galimybė išmėginti save moksliniame projekte. „Tai ne tik proga pagilinti žinias, bet ir išmokti dirbti didelėje, tarpdisciplininėje komandoje, įgyti praktinės patirties sprendžiant iššūkius. Pasibaigus projektui matau, kad prisijungti prie komandos buvo puikus sprendimas. Dalyvavimas tokiame projekte suteikia neįkainojamos patirties ir ugdo kompetencijas, kurios neabejotinai pravers tiek būsimoje karjeroje, tiek ir asmeniniame gyvenime“, – savo pasirinkimu džiaugiasi VU MIF studentė.
Konferencija Paryžiuje
Anot jos, bioinformatikos studijų programoje įgyjamos žinios jai itin pasitarnavo ruošiantis sintetinės biologijos konkursui. „Projekto metu man teko prisidėti atliekant bioinformatines analizes, dirbti su erkių platinamais patogenų genomais. Būtent studijų metu įgyti pagrindai ir išmokti metodai leido man sėkmingai atlikti šias užduotis, taip prisidedant prie projekto įgyvendinimo“, – pasakoja Viktorija.
Augustė teigia, kad „iGEM“ veikla jos dėmesį patraukė jai dalyvaujant VU MIF pirmakursių stovykloje, kurioje komandos nariai pasakojo apie galimybes prisidėti prie komandos ir dalyvauti konkurse, pritaikant IT žinias. „Mokykloje didelę dalį savo gyvenimo siejau su robotika, o šis konkursas pasirodė iš dalies panašus į kadaise taip mylėtą sritį, todėl iškart sudomino. Ilgai nelaukusi jau pirmame kurse aplikavau į naująją „iGEM“ komandą. Tiesą pasakius, nesitikėjau patekti, nes tuo metu dar neturėjau gerų programavimo žinių, nieko nenutuokiau apie biologiją“, – atvirauja Augustė.
Konkurso akimirka
Ji itin džiaugėsi sužinojusi, kad tapo komandos dalimi: „Pastarieji metai mane užaugino, sustiprinau savo programavimo žinias, susipažinau su begale įdomių žmonių. Jaučiuosi patobulėjusi tiek profesiniame kelyje, tiek asmeniškai. Konkursas leido įprasminti bei pritaikyti studijas realiame gyvenime“.
Informacinių sistemų inžineriją studijuojanti mergina sako, kad jos IT žinios prisidėjo prie komandos sėkmės. „Projekte vystėme informacinę sistemą, skirtą automatizuoti ir vykdyti Bradford baltymų koncentracijos apskaičiavimo metodą, pasitelkiant telefono kamerą vietoje tūkstančius kainuojančio laboratorinio spektrofotometro. ISI studijų programos metu įgytos projektavimo ir planavimo žinios padėjo šiai sistemai virsti realiu produktu, kurio veikiančią versiją vežėmės į Paryžių“, – pasakoja Augustė.
„iGEM“ – tai kasmetinis didžiausias tarptautinis sintetinės biologijos konkursas, kurio tikslas – skatinti sintetinės biologijos pažangą. Tarpdisciplininės universitetų studentų komandos iš viso pasaulio sprendžia globalias medicinos, maisto pramonės, energetikos ir kitų aktualių sričių problemas.