IT wiki

VU MIF STSC

User Tools

Site Tools

Kelias:
hpc

Skirtumai

Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.

Link to this comparison view

Both sides previous revisionPrevious revision
Next revision		Previous revision
Next revisionBoth sides next revision
hpc [2022/09/30 07:44] – [Programinė įranga] rolnashpc [2022/11/30 15:43] – [Programinė įranga] rolnas
Linija 25: Linija 25:
 <code shell> <code shell>
 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://python:3.8 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://python:3.8
-$ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas+$ mkdir -p /tmp/username 
 +$ singularity exec -H /tmp/username:/root -w /tmp/python pip install paketas
 $ singularity build python.sif /tmp/python $ singularity build python.sif /tmp/python
-$ rm -rf /tmp/python+$ rm -rf /tmp/python /tmp/username
 </code> </code>
 Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, kuriuose paketams instaliuoti nereikia naudotojo root teisių. Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, kuriuose paketams instaliuoti nereikia naudotojo root teisių.
Linija 33: Linija 34:
 Jeigu reikia papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/superuser teisių. Su fakeroot jas simuliuojame, o jam reikalingą biblioteką ''libfakeroot-sysv.so'' kopijuojame į konteinerį, pvz: Jeigu reikia papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/superuser teisių. Su fakeroot jas simuliuojame, o jam reikalingą biblioteką ''libfakeroot-sysv.so'' kopijuojame į konteinerį, pvz:
 <code shell> <code shell>
-$ singularity build --sandbox /tmp/python docker://ubuntu:18.04+$ singularity build --sandbox /tmp/python docker://ubuntu:20.04
 $ cp /libfakeroot-sysv.so /tmp/python/ $ cp /libfakeroot-sysv.so /tmp/python/
 $ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get update $ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get update
Linija 48: Linija 49:
  
 <code shell> <code shell>
-$ python3.7 -m pip install --upgrade pip setuptools wheel +$ python3.8 -m pip install --upgrade pip setuptools wheel 
-$ python3.7 -m pip install --ignore-installed batchspawner jupyterlab+$ python3.8 -m pip install --ignore-installed batchspawner jupyterlab
 </code> </code>
  
Linija 97: Linija 98:
  
 ^Eilė (partition) ^Laiko limitas ^RAM    ^Pastabos| ^Eilė (partition) ^Laiko limitas ^RAM    ^Pastabos|
-^main             ^7d            ^7000MB  ^CPU telkinys| +^main             ^nėra          ^7900MB  ^CPU telkinys| 
-^gpu              ^48h           ^12000MB ^GPU telkinys| +^gpu              ^nėra          ^12700MB ^GPU telkinys| 
-^power            ^48h           ^2000MB  ^IBM Power9 telkinys|+^power            ^nėra          ^8000MB  ^IBM Power9 telkinys|
  
-Visose eilėse užduotims laiko limitas yra **2h**, jei jis nebuvo nurodytas, o lentelėje yra pateiktas maksimalus leidžiamas laiko limitas.+Visose eilėse užduotims laiko limitas yra **2h**, jei jis nebuvo nurodytas, o lentelėje yra pateiktas maksimalus leidžiamas laiko limitas (nėra).
  
 **RAM** stulpelyje yra pateikiamas kiekvienam rezervuotam **CPU** branduoliui skiriamas RAM kiekis. **RAM** stulpelyje yra pateikiamas kiekvienam rezervuotam **CPU** branduoliui skiriamas RAM kiekis.
hpc.txt · Keista: 2024/02/21 12:50 vartotojo rolnas
Donate Powered by PHP Valid HTML5 Valid CSS Driven by DokuWiki