hpc
Skirtumai
Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.
Both sides previous revisionPrevious revisionNext revision | Previous revisionNext revisionBoth sides next revision | ||
hpc [2022/09/12 14:59] – [Registracija] grikiete | hpc [2022/11/30 17:47] – [Programinė įranga] rolnas | ||
---|---|---|---|
Linija 16: | Linija 16: | ||
====== Programinė įranga ====== | ====== Programinė įranga ====== | ||
- | **main** ir **gpu** yra instaliuota [[https:// | + | **main** ir **gpu** yra instaliuota [[https:// |
Instaliuotų OS paketų sąrašą galite pasitikrinti su komanda '' | Instaliuotų OS paketų sąrašą galite pasitikrinti su komanda '' | ||
Linija 25: | Linija 25: | ||
<code shell> | <code shell> | ||
$ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | $ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | ||
- | $ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas | + | $ mkdir ~/workdir |
+ | $ singularity exec -H ~/ | ||
$ singularity build python.sif /tmp/python | $ singularity build python.sif /tmp/python | ||
$ rm -rf /tmp/python | $ rm -rf /tmp/python | ||
+ | </ | ||
+ | Tam kad pasinaudoti tokiu konteineriu, | ||
+ | <code shell> | ||
+ | $ mkdir ~/workdir | ||
+ | $ singularity exec -H ~/ | ||
</ | </ | ||
Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | ||
Linija 33: | Linija 39: | ||
Jeigu reikia papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/ | Jeigu reikia papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/ | ||
<code shell> | <code shell> | ||
- | $ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | + | $ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// |
$ cp / | $ cp / | ||
$ fakeroot -l / | $ fakeroot -l / | ||
Linija 48: | Linija 54: | ||
<code shell> | <code shell> | ||
- | $ python3.7 -m pip install --upgrade pip setuptools wheel | + | $ python3.8 -m pip install --upgrade pip setuptools wheel |
- | $ python3.7 -m pip install --ignore-installed batchspawner jupyterlab | + | $ python3.8 -m pip install --ignore-installed batchspawner jupyterlab |
</ | </ | ||
Linija 97: | Linija 103: | ||
^Eilė (partition) ^Laiko limitas ^RAM | ^Eilė (partition) ^Laiko limitas ^RAM | ||
- | ^main ^7d | + | ^main ^nėra |
- | ^gpu ^48h ^12000MB | + | ^gpu ^nėra |
- | ^power | + | ^power |
- | Visose eilėse užduotims laiko limitas yra **2h**, jei jis nebuvo nurodytas, o lentelėje yra pateiktas maksimalus leidžiamas laiko limitas. | + | Visose eilėse užduotims laiko limitas yra **2h**, jei jis nebuvo nurodytas, o lentelėje yra pateiktas maksimalus leidžiamas laiko limitas |
**RAM** stulpelyje yra pateikiamas kiekvienam rezervuotam **CPU** branduoliui skiriamas RAM kiekis. | **RAM** stulpelyje yra pateikiamas kiekvienam rezervuotam **CPU** branduoliui skiriamas RAM kiekis. | ||
Linija 322: | Linija 328: | ||
* [[http:// | * [[http:// | ||
* [[https:// | * [[https:// | ||
- | * [[https:// | + | * [[https:// |
* [[http:// | * [[http:// | ||
* [[pagalba@mif.vu.lt]] - problemų su **HPC** registracija | * [[pagalba@mif.vu.lt]] - problemų su **HPC** registracija | ||
hpc.txt · Keista: 2024/02/21 12:50 vartotojo rolnas