hpc
Skirtumai
Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.
Both sides previous revisionPrevious revisionNext revision | Previous revisionNext revisionBoth sides next revision | ||
hpc [2022/03/29 09:09] – [Programinė įranga] rolnas | hpc [2022/07/18 09:56] – [Resursų limitai] grikiete | ||
---|---|---|---|
Linija 31: | Linija 31: | ||
Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | ||
- | Jeigu norima | + | Jeigu reikia |
<code shell> | <code shell> | ||
$ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | $ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | ||
Linija 59: | Linija 59: | ||
====== Registracija ====== | ====== Registracija ====== | ||
- | PST gali naudotis tik registruoti VU MIF kompiuterių tinklo naudotojai. Esami **VU MIF tinklo | + | * **VU MIF tinklo |
- | Registracijai reikia | + | * **VU kompiuterių tinklo naudotojams** - paslaugoms gauti turite |
- | Su suteiktu | + | * **Kitiems naudotojams |
- | + | ||
- | Adresu | + | |
====== Prisijungimas ====== | ====== Prisijungimas ====== | ||
Linija 71: | Linija 69: | ||
Norint prisijungti prie **PST** reikia naudoti SSH programas (ssh, putty, winscp, mobaxterm) ir Kerberos arba SSH raktų autentikaciją. | Norint prisijungti prie **PST** reikia naudoti SSH programas (ssh, putty, winscp, mobaxterm) ir Kerberos arba SSH raktų autentikaciją. | ||
- | Jeigu naudojate Kerberos: | + | Jeigu naudojate |
- | * Prisijungiate | + | * Prisijunkite |
- | * **arba** su ssh ar putty programa | + | * **arba** su ssh ar putty programa |
- | * Su komanda **klist** patikrinkite ar turite galiojantį Kerberos raktą (ticket). Jei rakto nėra arba jo galiojimo laikas pasibaigęs, | + | * Su komanda **klist** patikrinkite, ar turite galiojantį Kerberos raktą (ticket). Jei rakto nėra arba jo galiojimo laikas pasibaigęs, |
- | * Jungiatės į mazgą **hpc** su komanda **ssh hpc** (turi nereikalauti slaptažodžio). | + | * Junkitės į mazgą **hpc** su komanda **ssh hpc** (turi nereikalauti slaptažodžio). |
* **Pirmą kartą** prisijungus turi praeiti **5min**, kad galėtumėte naudotis PST. | * **Pirmą kartą** prisijungus turi praeiti **5min**, kad galėtumėte naudotis PST. | ||
- | Jeigu naudojate SSH raktus (pvz: jei norite kopijuoti didelius failus): | + | Jeigu naudojate |
* Jei neturite SSH raktų, instrukciją kaip juos susikurti Windows aplinkoje rasite **[[duk: | * Jei neturite SSH raktų, instrukciją kaip juos susikurti Windows aplinkoje rasite **[[duk: | ||
* | * | ||
- | * Prisijungiate | + | * Prisijunkite |
Pirmą kartą prisijungus jūs **negalėsite** paleisti **SLURM užduočių** per pirmąsias **5 minutes**. Po to jums bus automatiškai sukurtas **SLURM naudotojas** ir priskirti **resursų limitai**. | Pirmą kartą prisijungus jūs **negalėsite** paleisti **SLURM užduočių** per pirmąsias **5 minutes**. Po to jums bus automatiškai sukurtas **SLURM naudotojas** ir priskirti **resursų limitai**. | ||
Linija 122: | Linija 120: | ||
</ | </ | ||
- | Pateikus paraišką ITAPC ir gavus teigimą sprendimą, reikia susikurti naudotoją https:// | + | Pateikus paraišką ITAPC ir gavus teigimą sprendimą, reikia susikurti naudotoją https:// |
<code shell mpi-test-job.sh> | <code shell mpi-test-job.sh> | ||
Linija 172: | Linija 170: | ||
====== Interaktyvios užduotys (SLURM) ====== | ====== Interaktyvios užduotys (SLURM) ====== | ||
- | Interaktyvias užduotis galima | + | Interaktyvias užduotis galima vykdyti su komanda srun: |
< | < | ||
Linija 192: | Linija 190: | ||
$ ssh -X hpc | $ ssh -X hpc | ||
$ srun --pty $SHELL | $ srun --pty $SHELL | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | **power** telkinyje interaktyvias užduotis galima vykdyti su | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | $ srun -p power --mpi=none --pty $SHELL | ||
</ | </ | ||
Linija 233: | Linija 237: | ||
</ | </ | ||
- | Tai naudos visus paskirtus procesorius, | + | Bus naudojami visi paskirti procesoriai |
+ | |||
+ | **DĖMESIO: | ||
Daugiau apie instaliuotą **OpenMPI** yra [[https:// | Daugiau apie instaliuotą **OpenMPI** yra [[https:// | ||
Linija 241: | Linija 247: | ||
* Prašome išnaudoti ne mažiau 50% užsakyto CPU kiekio. | * Prašome išnaudoti ne mažiau 50% užsakyto CPU kiekio. | ||
* Naudoti daugiau CPU, nei užsakyta, nepadidins efektyvumo, nes jūsų užduotis galės naudoti tik tiek CPU, kiek buvo užsakyta. | * Naudoti daugiau CPU, nei užsakyta, nepadidins efektyvumo, nes jūsų užduotis galės naudoti tik tiek CPU, kiek buvo užsakyta. | ||
- | * Jeigu naudosite parametrą '' | + | * Jeigu naudosite parametrą '' |
====== Resursų limitai ====== | ====== Resursų limitai ====== | ||
Jeigu jūsų užduotys nestartuoja su priežastimi **AssocGrpCPUMinutesLimit** arba **AssocGrpGRESMinutes**, | Jeigu jūsų užduotys nestartuoja su priežastimi **AssocGrpCPUMinutesLimit** arba **AssocGrpGRESMinutes**, | ||
- | tai pasitikrinkite | + | turite pasitikrinti, |
- | Peržiūrėti kiek išnaudota resursų | + | *Pirmasis būdas peržiūrėti, kiek išnaudota resursų: |
< | < | ||
Linija 258: | Linija 264: | ||
Atkreipkite dėmesį, kad naudojimas pateikiamas minutėmis, o į valandas konvertuoti reikia dalinant iš 60. | Atkreipkite dėmesį, kad naudojimas pateikiamas minutėmis, o į valandas konvertuoti reikia dalinant iš 60. | ||
- | Kitas būdas | + | *Antrasis |
< | < |
hpc.txt · Keista: 2024/02/21 12:50 vartotojo rolnas