Skirtumai

Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.

--- hpc [2022/02/24 10:33] – [Registracija] rolnas
+++ hpc [2022/03/29 09:09] – [Programinė įranga] rolnas
@@ Linija 31: / Linija 31: @@
 Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, kuriuose paketams instaliuoti nereikia naudotojo root teisių.
-Jeigu norima papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/superuser teisių. Su fakeroot jas simuliuojame, o jam reikalingas bibliotekas kataloge ''/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot'' prikabiname į konteinerį, pvz:
+Jeigu norima papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/superuser teisių. Su fakeroot jas simuliuojame, o jam reikalingą biblioteką ''libfakeroot-sysv.so'' kopijuojame į konteinerį, pvz:
 <code shell>
 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://ubuntu:18.04
-$ mkdir /tmp/python/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot
+$ cp /libfakeroot-sysv.so /tmp/python/
-$ fakeroot singularity exec -B /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot -w /tmp/python apt-get update
+$ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get update
-$ fakeroot singularity exec -B /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot -w /tmp/python apt-get install python3.8 ...
+$ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get install python3.8 ...
-$ fakeroot singularity exec -B /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot -w /tmp/python apt-get clean
+$ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get clean
-$ rm -rf /tmp/python/var/lib/apt/lists (galima ir daugiau išvalyti, ko nereikia)
+$ rm -rf /tmp/python/libfakeroot-sysv.so /tmp/python/var/lib/apt/lists (galima ir daugiau išvalyti, ko nereikia)
 $ singularity build python.sif /tmp/python
 $ rm -rf /tmp/python
@@ Linija 45: / Linija 45: @@
 Kataloge ''/apps/local/bigdata'' yra paruošti scenarijai pasileisti savo **hadoop** užduotis pasinaudojant [[https://github.com/LLNL/magpie|Magpie]] rinkiniu.
-Su [[https://hpc.mif.vu.lt/hub|JupyterHub]] galite interneto naršyklės pagalba vykdyti skaičiavimus su python komandų eilute ir pasinaudoti [[https://jupyter.org|JupyterLab]] aplinka. Jeigu savo namų kataloge instaliuosite savo JupyterLab aplinką, tai reikia instaliuoti papildomai ''batchspawner'' paketą - tada jums startuos jūsų aplinką, pvz:
+Su [[https://hpc.mif.vu.lt/hub/|JupyterHub]] galite interneto naršyklės pagalba vykdyti skaičiavimus su python komandų eilute ir pasinaudoti [[https://jupyter.org|JupyterLab]] aplinka. Jeigu savo namų kataloge instaliuosite savo JupyterLab aplinką, tai reikia instaliuoti papildomai ''batchspawner'' paketą - tada jums startuos jūsų aplinką, pvz:
 <code shell>
@@ Linija 65: / Linija 65: @@
 Su suteiktu (pasirinktu) naudotojo vardu ir savo įvestu slaptažodžiu įgyjama teisė jungtis prie serverio **uosis.mif.vu.lt**, VU MIF mokymo klasių ir dalies VU MIF darbo vietų kompiuterių.
-Adresu [[https://hpc.mif.vu.lt|Waldur]] yra savitarnos portalas, kur su savo universiteto (eduGAIN arba LITNET tinkle) prisijungimu galima pačiam susikurti HPC prisijungimą. Daugiau info apie tai [[waldur|čia]].
+Adresu [[https://hpc.mif.vu.lt|Waldur]] yra savitarnos portalas, kur su savo universiteto (per **eduGAIN** arba **LITNET**) prisijungimu galima pačiam susikurti **HPC** prisijungimą. Daugiau info apie tai [[waldur|čia]].
 ====== Prisijungimas ======