Skirtumai

Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.

--- hpc [2021/12/15 13:51] – [Programinė įranga] rolnas
+++ hpc [2021/12/15 15:53] – [Programinė įranga] rolnas
@@ Linija 29: / Linija 29: @@
 $ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas
 $ singularity build python.sif /tmp/python
-$ rm -r /tmp/python
+$ rm -rf /tmp/python
 </code>
 Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, kuriuose paketams instaliuoti nereikia naudotojo root teisių.
@@ Linija 36: / Linija 36: @@
 <code shell>
 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://ubuntu:18.04
-$ singularity exec -w /tmp/python mkdir -p /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot
+$ mkdir /tmp/python/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot
-$ fakeroot singularity exec -w /tmp/python apt-get update
+$ fakeroot singularity exec -B /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot -w /tmp/python apt-get update
-$ fakeroot singularity exec -w /tmp/python apt-get install python3.8 ...
+$ fakeroot singularity exec -B /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot -w /tmp/python apt-get install python3.8 ...
+$ fakeroot singularity exec -B /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfakeroot -w /tmp/python apt-get clean
+$ rm -rf /tmp/python/var/lib/apt/lists (galima ir daugiau išvalyti, ko nereikia)
 $ singularity build python.sif /tmp/python
-$ rm -r /tmp/python
+$ rm -rf /tmp/python
 </code>
@@ Linija 52: / Linija 54: @@
 </code>
+Taip pat jūs galite pasinaudoti savo pasidarytu konteineriu per JupyterHub. Tame konteineryje reikia instaliuoti *batchswapner* ir ''jupyterlab'' paketus bei sukurti script'ą ''~/.local/bin/batchspawner-singleuser'' su vykdymo teisėmis (''chmod +x ~/.local/bin/batchspawner-singleuser'')
+<code shell>
+#!/bin/sh
+exec singularity exec --nv myjupyterlab.sif batchspawner-singleuser "$@"
+</code>
 ====== Registracija ======