hpc
Skirtumai
Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.
Both sides previous revisionPrevious revisionNext revision | Previous revisionNext revisionBoth sides next revision | ||
hpc [2021/12/14 10:05] – [Nuorodos ir mokymo medžiaga] mif28585 | hpc [2021/12/15 15:53] – [Programinė įranga] rolnas | ||
---|---|---|---|
Linija 29: | Linija 29: | ||
$ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas | $ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas | ||
$ singularity build python.sif /tmp/python | $ singularity build python.sif /tmp/python | ||
- | $ rm -r /tmp/python | + | $ rm -rf /tmp/python |
</ | </ | ||
Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | ||
+ | |||
+ | Jeigu norima papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/ | ||
+ | <code shell> | ||
+ | $ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | ||
+ | $ mkdir / | ||
+ | $ fakeroot singularity exec -B / | ||
+ | $ fakeroot singularity exec -B / | ||
+ | $ fakeroot singularity exec -B / | ||
+ | $ rm -rf / | ||
+ | $ singularity build python.sif /tmp/python | ||
+ | $ rm -rf /tmp/python | ||
+ | </ | ||
Kataloge ''/ | Kataloge ''/ | ||
Linija 42: | Linija 54: | ||
</ | </ | ||
+ | Taip pat jūs galite pasinaudoti savo pasidarytu konteineriu per JupyterHub. Tame konteineryje reikia instaliuoti '' | ||
+ | <code shell> | ||
+ | #!/bin/sh | ||
+ | exec singularity exec --nv myjupyterlab.sif batchspawner-singleuser " | ||
+ | </ | ||
====== Registracija ====== | ====== Registracija ====== | ||
Linija 217: | Linija 234: | ||
**1 mokymų dalis** | **1 mokymų dalis** | ||
- | - Trumpai apie HPC, kas tai yra, kam jo reikia | + | - Trumpai apie HPC, kas tai yra, kam jo reikia |
- | - Kokie HPC būna, koks yra VU ir kokia MIF dalis | + | - Kokie HPC būna, koks yra VU ir kokia MIF dalis |
- | - Kaip prisijungti MIF darbuotojams / studentams prie HPC | + | - Kaip prisijungti MIF darbuotojams / studentams prie HPC |
- | - SSH rakto kūrimas ir naudojimas Windows aplinkoje | + | - SSH rakto kūrimas ir naudojimas Windows aplinkoje |
- | - WinScp naudojimas Windows aplinkoje | + | - WinScp naudojimas Windows aplinkoje |
- | * [[https:// | + | * [[https:// |
- | * [[https:// | + | * [[https:// |
**2 mokymų dalis** | **2 mokymų dalis** | ||
- | - Slurm komandos darbams paleisti/ | + | - Slurm komandos darbams paleisti/ |
- | - Sbatch failas ir jo tipiniai parametrai CPU ir GPU particijoms | + | - Sbatch failas ir jo tipiniai parametrai CPU ir GPU particijoms |
- | - Darbai interaktyviu režimu ir darbai liekantys veikti po atsijungimo (Sbatch) | + | - Darbai interaktyviu režimu ir darbai liekantys veikti po atsijungimo (Sbatch) |
- | - Python/ | + | - Python/ |
- | - Singularity konteineriai: | + | - Singularity konteineriai: |
- | - Darbas su MPI | + | - Darbas su MPI |
- | - Rezultatų išvedimas ir parsisiuntimas į naudotojo kompiuterį | + | - Rezultatų išvedimas ir parsisiuntimas į naudotojo kompiuterį |
- | - Papildomų resursų užsakymai (Waldur) | + | - Papildomų resursų užsakymai (Waldur) |
- | * [[https:// | + | * [[https:// |
- | * [[https:// | + | * [[https:// |
* [[http:// | * [[http:// |
hpc.txt · Keista: 2024/02/21 12:50 vartotojo rolnas