Skirtumai

Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.

--- hpc [2021/11/10 11:53] – [Programinė įranga] rolnas
+++ hpc [2021/11/10 12:09] – [Programinė įranga] rolnas
@@ Linija 23: / Linija 23: @@
 Su komanda [[https://sylabs.io/guides/3.2/user-guide/index.html|singularity]] galima pasinaudoti jau paruoštomis konteinerių failų kopijomis kataloguose ''/apps/local/hpc'', ''/apps/local/nvidia'', ''/apps/local/intel'', ''/apps/local/lang'' arba pačiam atsisiųsti iš singularity ir docker internetinių katalogų. Pasinaudojus MIF cloud paslauga galima susikurti ir savo singularity konteinerius.
+Su singularity galite paruošti savo konteinerį, pvz:
+<code shell>
+$ singularity build --sandbox /tmp/python docker://python:3.8
+$ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas
+$ singularity build python.sif /tmp/python
+$ rm -r /tmp/python
+</code>
+Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, kuriuose paketams instaliuoti nereikia naudotojo root teisių.
 Kataloge ''/apps/local/bigdata'' yra paruošti scenarijai pasileisti savo **hadoop** užduotis pasinaudojant [[https://github.com/LLNL/magpie|Magpie]] rinkiniu.
-Su [[https://hpc.mif.vu.lt/hub|JupyterHub]] galite interneto naršyklės pagalba vykdyti skaičiavimus su python komandų eilute ir pasinaudoti [[https://jupyter.org|JupyterLab]] aplinka.
+Su [[https://hpc.mif.vu.lt/hub|JupyterHub]] galite interneto naršyklės pagalba vykdyti skaičiavimus su python komandų eilute ir pasinaudoti [[https://jupyter.org|JupyterLab]] aplinka. Jeigu savo namų kataloge instaliuosite savo JupyterLab aplinką, tai reikia instaliuoti papildomai ''batchspawner'' paketą - tada jums startuos jūsų aplinką, pvz:
+<code shell>
+$ python3.7 -m pip install --upgrade pip setuptools wheel
+$ python3.7 -m pip install --ignore-installed batchspawner jupyterlab
+</code>
 ====== Registracija ======