hpc
Skirtumai
Čia matote skirtumus tarp pasirinktos versijos ir esamo dokumento.
Both sides previous revisionPrevious revisionNext revision | Previous revisionNext revisionBoth sides next revision | ||
hpc [2021/06/30 08:42] – [Registracija] rolnas | hpc [2021/11/11 10:41] – [Prisijungimas] rolnas | ||
---|---|---|---|
Linija 3: | Linija 3: | ||
Paskirstytų skaičiavimų tinklas (PST) yra specialiai paruoštas kompiuterių tinklas, kuriame yra galimybė vykdyti programas, kurios galėtų efektyviai apsikeisti duomenimis. | Paskirstytų skaičiavimų tinklas (PST) yra specialiai paruoštas kompiuterių tinklas, kuriame yra galimybė vykdyti programas, kurios galėtų efektyviai apsikeisti duomenimis. | ||
- | **TESTUOJAMA | + | **Vyksta TESTAVIMAS |
VU MIF PST sudaro superkompiuteris iš telkinių (pirmas skaičius - faktiškai pasiekiamas kiekis): | VU MIF PST sudaro superkompiuteris iš telkinių (pirmas skaičius - faktiškai pasiekiamas kiekis): | ||
Linija 22: | Linija 22: | ||
Instaliuotų OS paketų sąrašą galite pasitikrinti su komanda '' | Instaliuotų OS paketų sąrašą galite pasitikrinti su komanda '' | ||
- | Su komanda [[https:// | + | Su komanda [[https:// |
+ | |||
+ | Su singularity galite paruošti savo konteinerį, | ||
+ | <code shell> | ||
+ | $ singularity build --sandbox /tmp/python docker:// | ||
+ | $ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas | ||
+ | $ singularity build python.sif / | ||
+ | $ rm -r / | ||
+ | </ | ||
+ | Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, | ||
Kataloge ''/ | Kataloge ''/ | ||
- | Su [[https:// | + | Su [[https:// |
+ | |||
+ | <code shell> | ||
+ | $ python3.7 -m pip install --upgrade pip setuptools wheel | ||
+ | $ python3.7 -m pip install --ignore-installed batchspawner jupyterlab | ||
+ | </ | ||
====== Registracija ====== | ====== Registracija ====== | ||
Linija 32: | Linija 46: | ||
PST gali naudotis tik registruoti VU MIF kompiuterių tinklo naudotojai. Esami **VU MIF tinklo naudotojai** PST gali naudotis **be papildomos registracijos**. | PST gali naudotis tik registruoti VU MIF kompiuterių tinklo naudotojai. Esami **VU MIF tinklo naudotojai** PST gali naudotis **be papildomos registracijos**. | ||
- | Registracijai reikia užpildyti [[http:// | + | Registracijai reikia užpildyti [[http:// |
- | Su suteiktu (pasirinktu) naudotojo vardu ir savo įvestu slaptažodžiu įgyjama teisė jungtis prie serverio uosis.mif.vu.lt, | + | Su suteiktu (pasirinktu) naudotojo vardu ir savo įvestu slaptažodžiu įgyjama teisė jungtis prie serverio |
Adresu [[https:// | Adresu [[https:// | ||
Linija 51: | Linija 65: | ||
Jeigu naudojate SSH raktus (pvz: jei norite kopijuoti didelius failus): | Jeigu naudojate SSH raktus (pvz: jei norite kopijuoti didelius failus): | ||
+ | * Jei neturite SSH raktų, instrukciją kaip juos susikurti Windows aplinkoje rasite [[duk: | ||
* | * | ||
* | * | ||
+ | |||
+ | Pirmą kartą prisijungus jūs **negalėsite** paleisti **SLURM užduočių** per pirmąsias **5 minutes**. Po to jums bus automatiškai sukurtas **SLURM naudotojas** ir priskirti **resursų limitai**. | ||
====== Bendra failų sistema (Lustre) ====== | ====== Bendra failų sistema (Lustre) ====== | ||
Linija 86: | Linija 102: | ||
#SBATCH -p main | #SBATCH -p main | ||
#SBATCH -n4 | #SBATCH -n4 | ||
+ | module load openmpi/ | ||
mpicc -o mpi-test mpi-test.c | mpicc -o mpi-test mpi-test.c | ||
mpirun mpi-test | mpirun mpi-test |
hpc.txt · Keista: 2024/09/24 07:03 vartotojo rolnas