Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- en:hpc [2022/07/05 10:11] – [GPU užduotys (SLURM)] grikiete
+++ en:hpc [2022/07/18 10:48] – [The Limits of Resources] grikiete
@@ Line 197: / Line 197: @@
 </code>
-====== GPU Tasks(SLURM) ======
+====== GPU Tasks (SLURM) ======
 To use GPU you need to specify additionally <code>--gres gpu:N</code> where N is desired GPU amount.
-Su ''nvidia-smi'' užduotyje galite pasitikrinti kiek GPU buvo paskirta.
+With ''nvidia-smi'' in the task you can check the GPU amount that was dedicated.
-Pavyzdys interaktyvios užduoties su 1 GPU:
+Example of an interactive task with 1 GPU:
 <code>
 $ srun -p gpu --gres gpu --pty $SHELL
 </code>
-====== Įvadas į OpenMPI ======
+====== Introduction to OpenMPI ======
-Ubuntu 18.04 LTS yra **2.1.1** versijos OpenMPI paketai.
+Ubuntu 18.04 LTS is the packet of **2.1.1** OpenMPI version.
-Norint pasinaudoti naujesne **4.0.1** versija reikia naudoti
+To use the newer version **4.0.1** you need to use
 <code>
 module load openmpi/4.0
 </code>
-prieš vykdant MPI komandas.
+before running MPI commands.
-===== MPI programų kompiliavimas =====
+===== MPI Compiling Programs =====
-Paprastos MPI programos pavyzdys yra kataloge ''/scratch/lustre/test/openmpi''. **mpicc** (**mpiCC**, **mpif77**, **mpif90**, **mpifort**) yra apvalkalai C (C++, F77, F90, Fortran) kompiliatoriams, kurie automatiškai įtraukia į komandų eilutę reikiamus **MPI** intarpų (include) ir bibliotekų failus.
+An example of a simple MPI program is in the directory ''/scratch/lustre/test/openmpi''. **mpicc** (**mpiCC**, **mpif77**, **mpif90**, **mpifort**) is a framework for C (C++, F77, F90, Fortran) compilers that automatically adds the necessary **MPI** include and library files to the command line.
 <code>
@@ Line 226: / Line 226: @@
 $ mpif90 -o foo foo.f
 </code>
-===== MPI programų vykdymas =====
+===== Implementation of MPI Programmes =====
-MPI programos startuojamos su **mpirun** arba **mpiexec** programa. Daugiau apie jas galima sužinoti su komanda **man mpirun** arba **man mpiexec**.
+MPI programs are started with **mpirun** or **mpiexec**. You can learn more about them with the **man mpirun** or **man mpiexec** command.
-Paprasta (SPMD) programa gali būti startuojama su tokia mpirun komandų eilute.
+A simple (SPMD) program can be started with the following mpirun command line.
 <code>
@@ Line 236: / Line 236: @@
 </code>
-Tai naudos visus paskirtus procesorius, pagal tai, kiek jų buvo užsakyta. Jeigu norima pasinaudoti mažiau, tai **mpirun** galima nurodyti parametrą ''-np kiekis''. Nepageidaujama ilgesniam laikui naudoti mažiau, nei rezervuota, nes neišnaudoti CPU lieka laisvi. Didesnį kiekį, nei rezervuotą, yra griežtai draudžiama naudoti, nes tai gali turėti įtakos kitų užduočių vykdymui.
+All allocated processors will be used according to the number ordered. If you want to use less, you can specify the -np quantity parameter in **mpirun**. It is not recommended to use less CPU than reserved for a longer time period, as unused CPUs remain free.
-Daugiau apie instaliuotą **OpenMPI** yra [[https://www.open-mpi.org|OpenMPI]] puslapyje.
+**ATTENTION** It is strictly forbidden to use more CPU than you have reserved, as this may affect the performance of other tasks.
-====== Užduočių efektyvumas ======
+Find more information on [[https://www.open-mpi.org|OpenMPI]].
-  * Prašome išnaudoti ne mažiau 50% užsakyto CPU kiekio.
+====== Task Efficiency ======
-  * Naudoti daugiau CPU, nei užsakyta, nepadidins efektyvumo, nes jūsų užduotis galės naudoti tik tiek CPU, kiek buvo užsakyta.
-  * Jeigu naudosite parametrą ''--mem=X'', tai užduotis gali rezervuoti daugiau **CPUs** proporcingai norimos atminties kiekiui. Pvz: užsakius ''--mem=14000'' eilėje **main**, bus užsakyti ne mažiau 2 CPUs, jei kiti parametrai nenurodo daugiau. Jeigu jūsų užduotis naudos mažiau, tai bus neefektyvus resursų naudojimas, be to tai gali veikti lėčiau, nes gali būti naudojama kita, nei vykdančio, procesoriaus atmintis.
-====== Resursų limitai ======
+  * Please use at least 50% of the ordered CPU quantity.
+  * Using more CPUs than ordered will not improve performance, as your task will only be able to use the CPUs ordered.
+  * If you use the ''--mem=X'' parameter, the task can reserve more **CPUs** in proportion to the amount of memory it wants. For example: if you order ''--mem=14000'' in the **main** queue, at least 2 CPUs will be reserved, unless other parameters specify more. If your task uses less than this, it will be an ineffective use of resources. In addition, it may run slower because it may use other memory than the executing CPU.
-Jeigu jūsų užduotys nestartuoja su priežastimi **AssocGrpCPUMinutesLimit** arba **AssocGrpGRESMinutes**,
+====== The Limits of Resources ======
- tai pasitikrinkite ar užduotims dar liko neišnaudotų CPU/GPU resursų iš (mėnesio) limito.
+If your tasks don't start because of **AssocGrpCPUMinutesLimit** or **AssocGrpGRESMinutes**,
+ you need to check if there are any unused CPU/GPU resources left from the monthly limit.
 Peržiūrėti kiek išnaudota resursų
@@ Line 269: / Line 271: @@
 kur **USERNAME** MIF naudotojo vardas. Arba parametre **-A** nurodyti tą sąskaitą (account), kurio naudojimą norima pažiūrėti. Duomenys pateikiami minutėmis. **GrpTRESRaw** - kiek išnaudota. **GrpTRESMins** - koks yra limitas. **TRESRunMins** - likę resursai dar vis vykdomų užduočių.
+====== Nuorodos ======
+  * [[waldur|HPC Waldur portalo aprašymas]]
+  * [[http://mif.vu.lt/itapc#paslaug%C5%B3-u%C5%BEsakymas|ITAPC paslaugų užsakymas]]
+  * [[https://slurm.schedmd.com/quickstart.html|Quick Start User Guide (SLURM)]]
+  * [[https://docs.qlustar.com/Qlustar/11.0/HPCstack/hpc-user-manual.html|HPC User Manual (Qlustar)]]
+  * [[http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/|MPI standartas]]
+  * pagalba@mif.vu.lt - problemų su **HPC** registracija