IT wiki

VU MIF STSC

User Tools

Site Tools


en:hpc

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revisionPrevious revision
Next revision
Previous revision
Next revisionBoth sides next revision
en:hpc [2022/04/14 13:43] – [Software] grikieteen:hpc [2022/04/14 13:51] – [Software] grikiete
Line 31: Line 31:
 Similarly, you can use R, Julia or other containers that do not require root privileges to install packages. Similarly, you can use R, Julia or other containers that do not require root privileges to install packages.
  
-Jeigu norima papildyti singularity kontainerį OS paketaistam reikia root/superuser teisiųSu fakeroot jas simuliuojameo jam reikalingą biblioteką ''libfakeroot-sysv.so'' kopijuojame į konteinerįpvz:+If you want to add OS packages to the singularity containeryou need root/superuser privilegesWith fakeroot, we simulate them, and copy the required library ''libfakeroot-sysv.so'' into the containerfor example:
 <code shell> <code shell>
 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://ubuntu:18.04 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://ubuntu:18.04
Line 38: Line 38:
 $ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get install python3.8 ... $ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get install python3.8 ...
 $ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get clean $ fakeroot -l /libfakeroot-sysv.so singularity exec -w /tmp/python apt-get clean
-$ rm -rf /tmp/python/libfakeroot-sysv.so /tmp/python/var/lib/apt/lists (galima ir daugiau išvalyti, ko nereikia)+$ rm -rf /tmp/python/libfakeroot-sysv.so /tmp/python/var/lib/apt/lists (you can clean up more of what you don't need)
 $ singularity build python.sif /tmp/python $ singularity build python.sif /tmp/python
 $ rm -rf /tmp/python $ rm -rf /tmp/python
 </code> </code>
  
-Kataloge ''/apps/local/bigdata'' yra paruošti scenarijai pasileisti savo **hadoop** užduotis pasinaudojant [[https://github.com/LLNL/magpie|Magpie]] rinkiniu.+There are ready-made scripts to run your **hadoop** tasks using the [[https://github.com/LLNL/magpie|Magpie]] set in the directory ''/apps/local/bigdata''.
  
-Su [[https://hpc.mif.vu.lt/hub/|JupyterHub]] galite interneto naršyklės pagalba vykdyti skaičiavimus su python komandų eilute ir pasinaudoti [[https://jupyter.org|JupyterLab]] aplinka. Jeigu savo namų kataloge instaliuosite savo JupyterLab aplinką, tai reikia instaliuoti papildomai ''batchspawner'' paketą - tada jums startuos jūsų aplinką, pvz:+With [[https://hpc.mif.vu.lt/hub/|JupyterHub]] galite interneto naršyklės pagalba vykdyti skaičiavimus su python komandų eilute ir pasinaudoti [[https://jupyter.org|JupyterLab]] aplinka. Jeigu savo namų kataloge instaliuosite savo JupyterLab aplinką, tai reikia instaliuoti papildomai ''batchspawner'' paketą - tada jums startuos jūsų aplinką, pvz:
  
 <code shell> <code shell>
en/hpc.txt · Last modified: 2024/02/21 12:50 by rolnas

Donate Powered by PHP Valid HTML5 Valid CSS Driven by DokuWiki