Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- en:hpc [2022/04/14 13:33] – grikiete
+++ en:hpc [2022/04/14 13:43] – [Software] grikiete
@@ Line 20: / Line 20: @@
 You can check the list of OS package with the command ''dpkg -l'' (in log in node **hpc** or in **power** nodes).
-Su komanda [[https://sylabs.io/guides/3.2/user-guide/index.html|singularity]] galima pasinaudoti jau paruoštomis konteinerių failų kopijomis kataloguose ''/apps/local/hpc'', ''/apps/local/nvidia'', ''/apps/local/intel'', ''/apps/local/lang'' arba pačiam atsisiųsti iš singularity ir docker internetinių katalogų. Pasinaudojus MIF cloud paslauga galima susikurti ir savo singularity konteinerius.
+With the command [[https://sylabs.io/guides/3.2/user-guide/index.html|singularity]] it is possible to make use of ready-made copies of container files in directories ''/apps/local/hpc'', ''/apps/local/nvidia'', ''/apps/local/intel'', ''/apps/local/lang'' or to download from singularity and docker online directories. You can also create your own singularity containers using the MIF cloud service.
-Su singularity galite paruošti savo konteinerį, pvz:
+With singularity you can prepare your container, for example:
 <code shell>
 $ singularity build --sandbox /tmp/python docker://python:3.8
-$ singularity exec -w /tmp/python pip install paketas
+$ singularity exec -w /tmp/python pip install package
 $ singularity build python.sif /tmp/python
 $ rm -rf /tmp/python
 </code>
-Analogiškai galima pasinaudoti R, Julia ar kitais konteineriais, kuriuose paketams instaliuoti nereikia naudotojo root teisių.
+Similarly, you can use R, Julia or other containers that do not require root privileges to install packages.
 Jeigu norima papildyti singularity kontainerį OS paketais, tam reikia root/superuser teisių. Su fakeroot jas simuliuojame, o jam reikalingą biblioteką ''libfakeroot-sysv.so'' kopijuojame į konteinerį, pvz: