| VU | MIF | VSL | STSC |
| Naujienos |
| Dažnos problemos |
| Studentams |
| Darbuotojams |
| Administratoriams |
| Naudotojų sąrašai |
| Programų sąrašai |
| Debesų kompiuterija |
| Skaičiavimų tinklas |
| Microsoft Imagine |
| Belaidis tinklas |
| Kompiuterių tinklas |
| Budėjimo grafikas |
Esant problemoms VU MIF kompiuterių tinkle rašykite adresu: pagalba@mif.vu.lt . |
Gaussian 09
Gaussian programos versija 09 Rev D.01 yra instaliuota kataloge /soft/gaussian/g09.
Gaussian gali naudoti tik gaussian grupės nariai.
Naudokite komandą g09slurm paleisti gaussian užduotis. Reikia nurodyti pradinį užduoties failą, procesorių kiekį, telkinį, eilę ir laiko limitą (minutėmis). Vienos užduoties procesorių kiekis yra apribotas telkinio vieno mazgo procesorių kiekiu. Gaussian programai skiriama 80% užduočiai skirtos atminties (RAM). Daugiau apie tai faile /soft/bin/g09slurm.
Daugiau informacijos apie Gaussian kurėjų puslapyje.
Gaussian licenzija yra PST faile /soft/gaussian/licenses/g09.pdf.
Tipiškas darbo su Gaussian scenarijus
$ ssh rolnas@uosis.mif.vu.lt rolnas@uosis.mif.vu.lt's password: Linux linux4 2.6.32-5-xen-amd64 #1 SMP Mon Jan 16 20:48:30 UTC 2012 x86_64 ... Last login: Fri Mar 9 14:49:50 2012 from matrix.mif linux4:~> klist Ticket cache: FILE:/tmp/krb5cc_1001 Default principal: rolnas@MIF Valid starting Expires Service principal 03/10/12 11:07:02 03/11/12 11:06:58 krbtgt/MIF@MIF linux4:~> ssh cluster Linux lxibm102 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Mon Jan 16 16:22:28 UTC 2012 x86_64 ... Last login: Fri Mar 9 15:07:01 2012 from linux4.mif lxibm102:~> mkdir -p /scratch/lustre/rolnas/gaussian lxibm102:~> cd /scratch/lustre/rolnas/gaussian lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> cp ~/gaussian/input.com . lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> ls -l total 0K -rw-r--r-- 1 rolnas rolnas 1136 Mar 25 2006 input.com lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> g09slurm input.com 12 alpha long 2880 Submitted batch job 235 lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> squeue JOBID PARTITION NAME USER ST TIME NODES NODELIST(REASON) lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> ls -l total 88K -rw-r--r-- 1 rolnas rolnas 1136 Mar 25 2006 input.com -rw-r--r-- 1 rolnas rolnas 67379 Mar 10 11:09 input.log lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> cp input.log ~/gaussian/ lxibm102:/scratch/lustre/rolnas/gaussian> logout Connection to cluster closed. linux4:~ logout Connection to uosis.mif.vu.lt closed.
Pastaba. Gaussian užduotys naudoja laikiną katalogą su pavadinimu input.scr, kur input - užduoties pradinio failo pavadinimas. Jeigu gaussian užduotis nutraukiama, tai gali tekti patiems jį ištrinti su komanda
> rm -rf input.scr